Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC117090L7N257 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC117090L7N257 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms