Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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