Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3542K7N6U2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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