Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21310J3QQ23 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21310J3QQ23 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21310J3QQ23 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21310J3QQ23 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21310J3QQ23 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21310J3QQ23 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm21310J3QQ23 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm21310J3QQ23 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm21310J3QQ23 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm21310J3QQ23 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm21310J3QQ23 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm21310J3QQ23 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm21310J3QQ23 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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