Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms