Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms