Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms