Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm3415J3QMS8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm3415J3QMS8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3415J3QMS8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Gm3415J3QMS8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm3415J3QMS8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3415J3QMS8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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