Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms