Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HrcG5E8J6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms