Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r58G3X9U3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms