Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3371F7CQW8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms