Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rarres1F6ZIS7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rarres1F6ZIS7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms