Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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