Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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