Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85cE9Q6B2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85cE9Q6B2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms