Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BC051665E9Q623 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms