Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc71lE9Q4T4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms