Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms