Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ddx60E9PZQ1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ddx60E9PZQ1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ddx60E9PZQ1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ddx60E9PZQ1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ddx60E9PZQ1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ddx60E9PZQ1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ddx60E9PZQ1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ddx60E9PZQ1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ddx60E9PZQ1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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