Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms