Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc8E9PWG2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms