Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms