Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan18E9PUD6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan18E9PUD6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms