Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5934D3Z4U6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms