Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SafbD3YXK2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms