Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms