Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC048679D3YXE9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC048679D3YXE9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms