Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx8D3YU81 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms