Protein–RNA interactions for Protein: D2EAC2

Zbed6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed6D2EAC2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zbed6D2EAC2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed6D2EAC2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed6D2EAC2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed6D2EAC2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed6D2EAC2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed6D2EAC2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms