Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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