Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clrn2B2RVW2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms