Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms