Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usf3B2RUQ2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms