Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol7aB2RT54 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms