Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms