Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms