Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samt1A2BED8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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