Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms