Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms