Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubl3Q9Z2M6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms