Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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