Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ap3b1Q9Z1T1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms