Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms