Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms