Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Psmb3Q9R1P1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms