Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gpc6Q9R087 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms