Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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