Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

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Length 761 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Phtf1Q9QZ09 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Phtf1Q9QZ09 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Phtf1Q9QZ09 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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