Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms